Marzione,
per l'esecuzione del watermarker uso Photoshop e
qui trovi il tutorial per farlo e per registrare un'azione che lo farà applicare automaticamente tutte le volte che ti serve.
Se non hai photoshop puoi ugualmente vedere col tuo programma di seguire le indicazioni, se hai problemi chiedi pure che vediamo di risolvere. Comunque mi pare che in rete ci sono programmi free per farlo e forse anche lo puoi fare su qualche sito in rete.
Se mi viene sott'occhio qualcosa che ti può essere utile ti posto il link.